《穹顶之下》的结局中，小镇居民在穹顶下挣扎求生，最终科巴尔揭示了穹顶是外星生物设置的实验装置。神秘组织“盖亚健康”试图通过穹顶净化地球，但导致大量人员伤亡。在绝望中，乔伊引爆了地下基站，穹顶暂时消失，居民得以逃脱。然而，乔伊不幸牺牲，他的英勇行为让外界救援队赶到，将幸存者救出。故事以希望与牺牲为主题，展现了人性在危机中的复杂面貌。